北京南苑地区的主要河流有 凉水河、小龙河和凤河。这些河流在南苑的形成和发展中起到了重要作用，为当地的生态、水系治理和御灾等方面提供了重要的支持。

凉水河：

凉水河是北魏时期永定河的故道，主河道南徙后成为平地导源的河流。永定河冲积扇潜水溢出带上的泉水成为凉水河的主要水源。

小龙河：

小龙河也是南苑地区的重要河流之一，与凉水河、凤河一起，构成了南苑复杂的水系。

凤河：

凤河是元代永定河的故道，因其形状如凤而得名。凤河流经南苑地区，为当地的生态环境和水资源提供了重要保障。

这些河流不仅为南苑提供了丰富的水资源，还形成了多个湖泊和泡子，如饮鹿池、眼镜湖、大泡子、二海子、三海子、四海子、五海子等，进一步丰富了南苑的生态系统。