2020年1月12日，世界卫生组织正式将造成武汉肺炎疫情的新型冠状病毒命名为“2019新型冠状病毒（2019-nCoV）”。与此同时，新型冠状病毒肺炎也在境外出现。2021年3月30日，中国—世卫组织新冠病毒溯源联合研究报告在日内瓦发布，报告显示，武汉华南海鲜市场不是新冠病毒最初来源地。

2020年2月8日，国家卫健委新闻发言人现场发布了关于新冠病毒感染的肺炎暂命名的通知：新型冠状病毒感染的肺炎统一称谓为“新型冠状病毒肺炎”，简称“新冠肺炎”，英文名为“Novel coronavirus pneumonia”，简称为“NCP”。

2023年8月16日，世界卫生组织宣布，将新型冠状病毒疫情重新命名为COVID-19，以取代之前的不准确命名。

因此，武汉疫情最初被称为“2019新型冠状病毒（2019-nCoV）”或“新型冠状病毒感染的肺炎”，后来统一命名为“新型冠状病毒肺炎”，简称“新冠肺炎”，英文名为“COVID-19”。