鄯善县的主要火车站是 鄯善站，它位于新疆维吾尔自治区吐鲁番地区鄯善县火车站镇。鄯善站是兰新铁路上的一座火车站，离兰州站1609公里，离乌鲁木齐站283公里。该站隶属于乌鲁木齐铁路局乌鲁木齐车务段管辖，现为三等站。车站及相邻上下行区间均为复线电气化区段。

此外，鄯善县还有两个高铁站，分别是鄯善北站和吐哈站。鄯善北站位于吐鲁番市鄯善县境内，隶属于中国铁路乌鲁木齐局集团有限公司，是兰新高速铁路上的一个客运站。吐哈站也位于吐鲁番市鄯善县火车站镇境内，为兰新客运专线上的一个铁路车站，始建于2009年，隶属中国铁路乌鲁木齐局集团有限公司管辖，现为三等站。

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