诸葛亮有两个儿子，他们分别是 诸葛瞻和 诸葛怀。诸葛瞻是诸葛亮的亲生儿子，字思远，琅琊郡阳都县（今山东省沂南县）人。他迎娶公主，拜骑都尉，袭爵武乡侯。在蜀汉后期，诸葛瞻与辅国大将军董厥并为平尚书事，统领中央事务。后主宠信黄皓，他无所匡正。最终，在魏将邓艾伐蜀时，诸葛瞻率军至涪迎战，因寡不敌众，壮烈战死。

诸葛怀是诸葛亮的幼子，也出自清代史学家张澍的《诸葛忠武侯文集故事卷一·杂记》。不过，关于诸葛怀的信息较少，他未曾到京城任职，且英年早逝。

此外，诸葛乔也是诸葛亮养子，原为其兄诸葛瑾的二子，字伯松，后改字仲慎，官至翊武将军。他本为诸葛瑾次子与胞兄诸葛恪在吴国的名声颇大，后被过继给诸葛亮。到蜀国后，任驸马都尉。诸葛亮视他如亲生儿子，深恐其成为庸人，管教甚严。

综上所述，诸葛亮的两个亲生儿子分别是诸葛瞻和诸葛怀，而诸葛乔则是他的养子。