红旗渠的设计者主要是 吴祖太。吴祖太是红旗渠首张蓝图的设计者和初绘者，也是第一位为红旗渠献身的人。他在红旗渠工程设计中发挥了重要作用，与其他工程技术人员一起爬山越岭，实地勘测，翻阅大量资料，精心设计，每天工作到深夜，最终拿出了红旗渠第一本蓝图。

此外，虽然杨贵也被提及为红旗渠的总设计师，并且他在任林县县委书记期间主持修建了红旗渠，但根据现有资料，吴祖太在红旗渠设计中的贡献更为突出，被广泛认为是红旗渠的主要设计者。