温州动车追尾事故是一起因列控中心设备存在严重设计缺陷、上道使用审查把关不严、雷击导致设备故障后应急处置不力等因素造成的责任事故。事故发生后，国务院成立了事故调查组，对事故原因进行了详细调查，并公布了处理结果。

事故原因

列控中心设备存在严重设计缺陷。

上道使用审查把关不严。

雷击导致设备故障后应急处置不力。

处理结果

认定54名责任人，包括铁道部原部长刘志军、副部长陆东福、总工程师何华武、原副总工程师兼运输局原局长张曙光等，分别受到不同程度的党纪政纪处分。

对于涉嫌犯罪的，司法机关正在依法独立开展调查。

铁道部和铁道部部长盛光祖分别向国务院作出深刻检查。

国资委对通信信号集团公司、通信信号股份有限公司及下属通信信号研究设计院依法进行整顿，重新组建通信信号研究设计院列控所。

事故影响

事故共造成40人死亡、172人受伤，中断行车32小时35分，直接经济损失19371.65万元。

后续处理

事故调查组建议对通信信号集团公司、通信信号股份有限公司及下属通信信号研究设计院进行整顿，重新组建通信信号研究设计院列控所。

综上所述，温州动车追尾事故的处理结果包括对54名责任人的纪律处分，司法机关对涉嫌犯罪人员的调查，以及铁道部和相关企业的整改要求。事故教训深刻，对相关责任人员的处理显示了政府对安全生产的高度重视和严肃态度。