大学毕业论文指导书通常由指导老师撰写。在大多数情况下，指导老师会在每次指导学生完成论文后填写相关内容。如果学生不主动找老师沟通或自行修改，指导书可以留空并要求延期毕业。此外，也有观点认为，虽然理论上应由指导老师撰写，实际操作中可能由导师带的研究生完成。

综合以上信息，可以明确的是，大学毕业论文指导书的主要撰写者是学生的指导老师。学生在撰写过程中应主动与指导老师沟通，以确保指导书的及时完成和论文质量。