三国时期的荆州，根据历史记载，其下辖的郡有以下几个：

南阳郡：

位于今河南南部和湖北北部，是汉光武帝的家乡，也是当时天下第一大郡。

南郡：

位于今湖北中西部，包括湖北襄阳剩余部分以及湖北中部的江汉平原和湖北西部的山区，赤壁之战后，南郡成为三国争夺的焦点之一。

江夏郡：

位于今湖北东部，遍布山川沼泽，人口相对较少。

零陵郡：

位于今湖南南部。

桂阳郡：

位于今湖南东部。

武陵郡：

位于今湖南西部。

长沙郡：

位于今湖南东部。

需要注意的是，在三国时期，荆州的范围和行政区划有所变化。赤壁之战后，曹操、刘备、孙权三家分荆州，其中刘备获得了零陵郡、桂阳郡、武陵郡和长沙郡，曹操获得了南阳郡和南郡的一部分，孙权则获得了江夏郡。此外，还有记载提到曹操从南郡和南阳郡中分出襄阳郡和南乡郡（一说章陵郡），使得荆州的郡数有所增加。

综上所述，三国时期的荆州共有七个郡，分别是南阳郡、南郡、江夏郡、零陵郡、桂阳郡、武陵郡和长沙郡。