在《爱情公寓》中，吕子乔和陈美嘉的感情线一直备受关注。尽管他们之间有着明显的相互吸引和感情基础，但两人并未最终走到一起。以下是一些可能的原因：

人物设定和剧情需要：

吕子乔被设定为一个风流成性、不务正业的角色，而陈美嘉则是一个单纯善良的女孩。这样的角色设定使得他们在一起时会产生很多矛盾和冲突，从而增加了剧情的戏剧性。编剧可能认为，保持他们之间的不和谐关系，更符合剧情的发展。

吕子乔的犹豫和退却：

吕子乔虽然对陈美嘉有深厚的感情，但他知道自己并不是一个值得依靠的人。他害怕自己的行为会伤害到陈美嘉，因此选择了隐藏自己的感情，不向她表白。这种默契使得他们在一段时间内没有在一起。

经济压力：

有观点认为，吕子乔和陈美嘉之所以没有在一起，是因为经济压力。为了减轻陈美嘉的生活负担，吕子乔曾经假装与她分手，并搬出去住。这种现实压力可能也是他们未能在一起的一个重要原因。

感情线的发展：

在剧情的发展中，吕子乔和陈美嘉的感情线经历了多次波折。例如，吕子乔在第三部中成为了第三者，而陈美嘉则爱上了关谷神奇。这些感情线的变化使得他们的关系变得更加复杂，也使得他们最终未能在一起。

吕子乔的自我认知：

吕子乔在剧情中逐渐认识到自己的情感，并意识到自己深爱着陈美嘉。然而，他害怕自己无法给陈美嘉幸福，因此选择了逃避。这种自我认知的过程也影响了他们最终的感情走向。

剧情的悬念：

编剧可能故意留下了一些悬念，使得观众对吕子乔和陈美嘉的感情线保持关注。这种处理方式不仅增加了剧情的吸引力，也使得角色的情感更加丰富和立体。

综上所述，吕子乔和陈美嘉未能在一起的原因是多方面的，包括人物设定、剧情需要、经济压力、感情线的发展、吕子乔的自我认知以及编剧的悬念处理等。这些因素共同作用，使得他们的感情线成为《爱情公寓》中一个备受关注和讨论的话题。