EMS开头的运单号含义如下：

E：

代表Express（特快专递）。

第二个字母：

是序列号，用于区分不同的邮件。

最后两位字母：

CN代表中国。

因此，EMS开头的运单号通常由两个英文字母（代表特快专递）和一个序列号组成，最后两位字母CN表示该邮件是由中国发出的。例如，一个典型的EMS运单号可能是`EA123456789CN`，其中`EA`是序列号，`123456789`是中间的数字，`CN`表示中国。

建议：在查询EMS邮件信息时，确保运单号完整且正确，以便能够顺利获取邮件的最新状态。